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第1話：メガネの子供たち

ヤサコこと小此木優子と妹の京子は、金沢から大黒市へと引っ越してきた。ヤサコはそこで、謎の電脳生物を追いかけていった京子と電脳ペットのデンスケとはぐれてしまう。電脳メガネでデンスケを見つけたものの…。

第2話：コイル電脳探偵局

ヤサコとフミエは、サッチーの攻撃を何とかかいくぐり、デンスケを救出。しかし、デンスケは謎のウイルスに感染していた。そこで、フミエの親玉にしてヤサコの祖母・メガばあが電脳グッズを駆使して治療を試みる。

第3話：優子と勇子

ヤサコは転校初日を迎え、その留守の間にモジョがデンスケを誘拐した。救出に向かったヤサコとフミエは、モジョの反撃を受けながらも追跡を続ける。しかし、そんな2人の前にサッチーが立ちはだかる。

第4話：大黒市黒客クラブ

六年三組に転校生がやってきた。それは、何と昨日デンスケを誘拐したイサコこと天沢勇子だった。イサコは、ダイチがリーダーの「大黒黒客」へと勧誘されたが、これを冷たく拒否。放課後にダイチたちから攻撃される。

第5話：メタバグ争奪バスツアー

ダイチたちは、この街のどこかにメタバグが大量に埋まっているという噂を聞きつけた。その在りかを知っていると言うイサコに同行すると、たどり着いた先は電脳霧が立ち込める「バスの墓場」だった。

第6話：赤いオートマトン

ヤサコたちに襲いかかるサッチーに命令をして停止させたのは、何とハラケンだった。サッチーはハラケンのペットだったのだ。フミエとヤサコはハラケンの正体を探るべく、まずはサッチーの生態を観察する。

第7話：出動!!コイル探偵局

ヤサコとフミエは、メガばあから電脳ペットのマンタの捜索を指示される。報酬は何とキラバグだった。ヤサコたちは目撃情報をもとに廃工場へと向かうと、そこにはイサコがイリーガルを捕まえようとしていて…。

第8話：夏祭り、そして果たし合い

すっかり黒客を支配下におさめたイサコは、ダイチたちにある命令を下した。イリーガル探索に邪魔となるフミエたちに果たしあいを申し込み、これに勝利してフミエたちから電脳メガネを取り上げろというものだった。

第9話：あっちのミチコさん

黒客とフミエたちの果たしあいの日。深夜の学校で肝試しを行い、負けた方はメガネを捨てなければならない。ダイチやヤサコたちは校舎内のあちこちに電脳トラップを仕かけていくが、そこへオバちゃんが侵入してくる。

第10話：カンナの日記

イサコはキラバグを体に吸収してサッチーを倒し、さらにオバちゃんに毒づく。黒客から追放されてしまったダイチは、デンパと共に「元祖黒客」を旗揚げした。ヤサコとフミエは、ハラケンが手に入れた道順をたどり…。

第11話：沈没！大黒市

ダイチはイリーガルを捕まえてメタバグを稼ごうと、イリーガルの小さな金魚を育て始める。しかし、金魚はどんどん巨大化して、ついに街に飛び出し水浸しにしていく。コイル探偵局メンバーが立ち上がり…。

第12話：ダイチ、発毛ス

ダイチはイリーガルを捕獲しようとやっきになっているが、全く成果が上がらない。そんなある日、ダイチの顔に電脳ヒゲがびっしりと生えてしまう。さらに、それは感染力が強く、ヤサコたちも次々と伝染する。

第13話：最後の首長竜

ヤサコとハラケンは、カンナの日記を手掛かりに古い空間を見つけた。そこでイリーガルのクビナガ竜を飼うデンパに出会い、デンパはみんなには内緒にしてほしいと言う。その場所で建設工事が始まることがわかり…。

第14話：いきものの記録

アキラは、電脳猫のミゼットを使って姉のフミエの行動を記録し始めた。いざという時のために、自分に横暴な姉の証拠を取っておくためだ。一方ハラケンは、大黒市で起きた出来事を調べている青年・猫目と出会う。

第15話：駅向こうの少年

デパートからの帰り道に、ヤサコは道に迷ってしまう。さらに、イサコと間違えられて、「キラバグを出せ」と、見知らぬ少年たちに追われてしまう。そんなヤサコを助けたのはタケルで、彼と一緒に歩いていると…。

第16話：イサコの病室

ある日、ヤサコは病院までギックリ腰のメガばあを迎えにいく。そこでヤサコは、病院内で盗み撮りを行うアキラの姿を見かける。アキラを問い詰めるヤサコだったが、映像の中にイサコの秘密も記録されていた。

第17話：最後の夏休み

ヤサコはハラケンにイサコの秘密を伝えた。ハラケンは、どこか思い詰めた様子で、ヤサコは不安を覚える。一方、ガチャギリとナメッチを従えてイリーガルを追うイサコに対し、オバちゃんは奥の手を使って決戦を挑む。

第18話：異界への扉

イサコは壮絶なバトルの末に、ついにキラバグを集め切った。そして、暗号式で、謎の電脳空間「通路」を出現させた。虚ろな目で「通路」の中に足を踏み入れようとするハラケンにヤサコが歩み寄るのだが…。

第19話：黒い訪問者

突如ヤサコの家が停電し、湧き上がる電脳霧から「通路」と謎のイリーガル「ヌル」が出現。ヌルは京子を襲い、その電脳体を連れ去ってしまう。ヤサコとフミエも闇の中を追い詰められるが、メガばあの結界に救われた。

第20話：カンナとヤサコ

再び通路へと向かったハラケンの身に危険が迫る。ヤサコとオバちゃんはハラケンの後を追い、そんななかオバちゃんは自らの過去を語り始める。ヤサコはハラケンを救うために思いがけない行動に出る。

第21話：黒いオートマトン

今日から新学期。学校は第一小と合併し、新しい駅ビルに移転した。ヤサコはタケルとの再会に喜ぶ一方、目覚めないハラケンのことが気がかりだった。イサコはなぜか第一小の生徒たちから執拗な嫌がらせを受け始める。

第22話：最後のコイル

新型サッチーに追い詰められたイサコをヤサコが助け、小此木家に避難する。イサコが、京子からデンスケの治療を頼まれて調べると、デンスケにはある秘密が隠されていることが判明。そこへ新型サッチーが現れる。

第23話：かなえられた願い

大規模なフォーマットが繰り広げられるなか、ダイチたちは京子とデンスケを守るために逃げ回る。同様に逃げるイサコは、幼い頃の記憶が蘇ってきた。そんなイサコに猫目から電話がかかってくる。

第24話：メガネを捨てる子供たち

ヤサコは昨夜の事件で気を失い、病院で目覚めた。イサコの噂はすぐに広まり、子供たちは親に眼鏡を取り上げられてしまう。ヤサコは、現実を受け入れられずにいた。一方、オバちゃんはイサコを助けるために…。

第25話：金沢市はざま交差点

ヤサコは、イサコを助けるために金沢に向かった。元クラスメイトのマユミに会って、都市伝説に出てくるはざま交差点の手掛かりを得ようとする。ヤサコはアッチの空間に侵入するが、新型サッチー2.0が来襲する。

第26話：ヤサコとイサコ

ついに4423の謎が明らかになった。ヤサコも過去の記憶を呼び戻し、4423と出会ったあの時にいったい何が起きたのかをたどっていく。そして、アッチとは何か、都市伝説の少女・ミチコさんの正体などが明らかになる。